Hagenbach was the son of C. F. Hagenbach, professor of medicine at Basel. He studied at the Universities of Basel, Bonn, and Berlin, returning to Basel in 1823 as a university lecturer on church history. He was appointed professor of church history in 1829.
Hagenbach’s hymns appeared mainly in his Gedichte (Basel, Switzerland: 1846), a book of poems. His other works include:
- Tabellarische Übersicht der Dogmengeschichte, 1828
- Luther und Seine Zeit, 1838
- Jakob Sarasin und Seine Freunde, 1846
- Die Kirchengeschichte des 18. und 19. Jahrhunderts: Aus dem Standpunkte des Evangelischen Protestantismus, 1848
- Leitfaden zum Christlichen Religionsunterricht an Höheren Gymnasien (Leipzig, Germany: 1850)
- Wilhelm Martin Leberecht de Wette (Basel, Switzerland: 1850)
- Vorlesungen über die Geschichte der alten Kirche, 1853–55
- Lieder in Liebe und Leid an eine Vollendete, 1855
- Predigten (Basel, Switzerland: 1858–75)
- Über die Sogenannte Vermittlungstheologie. Zur Abwehr und Verständigung, 1858
- Johann Oekolampad und Oswald Myconius, die Reformatoren Basels, 1859
- Vorlesungen über die Kirchengeschichte des Mittelalters, 1860
- Die Theologische Schule Basels und Ihre Lehrer, 1860
- Grundlinien der Liturgik und Homiletik (Leipzig, Germany: 1863)
- German Rationalism, in Its Rise, Progress, and Decline, 1865
- Über Ziel und Richtpunkte der Heutigen Theologie, 1867
- Über Glauben und Unglauben, 1872
- Encyklopädie und Methodologie der Theologischen Wissenschaften, 1889
- Vorlesungen über Wesen und Geschichte der Reformation und des Protestantismus, 1834–43
- Lehrbuch der Dogmengeschichte, 1888
